Τμήμα Συλλογών και Εκθέσεων Μεταλλοτεχνίας και Μικροτεχνίας είναι υπεύθυνο για τη μελέτη, καταγραφή, προστασία και ανάδειξη μουσειακών αντικειμένων όπως αγγεία, ειδώλια, σκεύη, ομοιώματα αντικειμένων, αγάλματα, όπλα, κοσμήματα, εργαλεία και άλλους είδους τεχνουργήματα, τα οποία είναι είτε κατασκευασμένα εξολοκλήρου από μέταλλο, ή από άλλο υλικό αλλά επιμεταλλωμένα, ή από μέταλλο σε συνδυασμό με άλλο υλικό (π.χ. μετάλλινα κοσμήματα με πολύτιμους λίθους), νομίσματα, έργα μικροτεχνίας (κοσμήματα, εργαλεία, σφραγιδόλιθοι και άλλου είδους τεχνουργήματα) κατασκευασμένα από κάθε είδους υλικό πλην πηλού, φαγεντιανής, γυαλιού και οργανικών υλικών, που χρονολογούνται από την προϊστορική έως την υστερορωμαϊκή περίοδο. 

Επιπλέον, διαχειρίζεται και υλοποιεί ερευνητικά και συγχρηματοδοτούμενα προγράμματα, οργανώνει εκθέσεις, αναπτύσσει επιστημονικές και επικοινωνιακές δράσεις και υποστηρίζει την πρόσβαση ερευνητών στο αρχαιολογικό υλικό. Αξιοποιεί τις τεχνολογίες πληροφορικής, εκπονεί εκπαιδευτικό υλικό και διοργανώνει διαλέξεις και συνέδρια, σε συνεργασία με άλλους φορείς και τμήματα του Μουσείου.