Το Τμήμα Ψηφιακής Διακυβέρνησης είναι αρμόδιο για τις στρατηγικές κατευθύνσεις του μουσείου σε θέματα τεχνολογιών πληροφορικής, την παρακολούθηση της εφαρμογής τους και την αξιολόγηση της αποτελεσματικότητάς τους.

Μεριμνά για τον σχεδιασμό, την ανάπτυξη, την υποστήριξη και τη συντήρηση της τεχνικής υποδομής και των εφαρμογών ψηφιακής διακυβέρνησης και ηλεκτρονικής πληροφόρησης στο Διαδίκτυο και για την απρόσκοπτη λειτουργία των κεντρικών συστημάτων πληροφορικής του μουσείου και των συστημάτων ψηφιακής διαχείρισης των συλλογών. Φροντίζει για τη βελτίωση των διαδικασιών ασφάλειας των συστημάτων πληροφορικής, για τον λογικό σχεδιασμό των εφαρμογών λογισμικού και των βάσεων δεδομένων, καθώς και για τις αναγκαίες επεκτάσεις και βελτιώσεις των πληροφοριακών συστημάτων του Μουσείου.

Τέλος, συμμετέχει στην υποβολή προτάσεων συγχρηματοδοτούμενων έργων με αντικείμενο την ανάπτυξη καινοτόμων εφαρμογών ψηφιακής διακυβέρνησης.